Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gbp2Q9Z0E6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gbp2Q9Z0E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gbp2Q9Z0E6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gbp2Q9Z0E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gbp2Q9Z0E6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gbp2Q9Z0E6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gbp2Q9Z0E6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gbp2Q9Z0E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gbp2Q9Z0E6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Gbp2Q9Z0E6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gbp2Q9Z0E6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gbp2Q9Z0E6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp2Q9Z0E6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gbp2Q9Z0E6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gbp2Q9Z0E6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,7 ms