Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PapolbQ9WVP6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PapolbQ9WVP6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PapolbQ9WVP6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PapolbQ9WVP6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PapolbQ9WVP6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PapolbQ9WVP6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PapolbQ9WVP6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PapolbQ9WVP6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PapolbQ9WVP6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PapolbQ9WVP6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PapolbQ9WVP6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PapolbQ9WVP6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PapolbQ9WVP6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PapolbQ9WVP6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms