Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Carm1Q9WVG6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carm1Q9WVG6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carm1Q9WVG6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carm1Q9WVG6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Carm1Q9WVG6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Carm1Q9WVG6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Carm1Q9WVG6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Carm1Q9WVG6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carm1Q9WVG6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Carm1Q9WVG6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Carm1Q9WVG6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carm1Q9WVG6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carm1Q9WVG6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Carm1Q9WVG6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Carm1Q9WVG6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms