Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd6ipQ9WU78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdcd6ipQ9WU78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdcd6ipQ9WU78 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcd6ipQ9WU78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdcd6ipQ9WU78 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd6ipQ9WU78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcd6ipQ9WU78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pdcd6ipQ9WU78 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdcd6ipQ9WU78 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdcd6ipQ9WU78 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdcd6ipQ9WU78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcd6ipQ9WU78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcd6ipQ9WU78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcd6ipQ9WU78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcd6ipQ9WU78 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdcd6ipQ9WU78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcd6ipQ9WU78 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcd6ipQ9WU78 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms