Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpv2Q9WTR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpv2Q9WTR1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpv2Q9WTR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpv2Q9WTR1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpv2Q9WTR1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv2Q9WTR1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trpv2Q9WTR1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpv2Q9WTR1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms