Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax2Q9WTP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax2Q9WTP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vax2Q9WTP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vax2Q9WTP9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vax2Q9WTP9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vax2Q9WTP9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms