Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Abcc6Q9R1S7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Abcc6Q9R1S7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Abcc6Q9R1S7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Abcc6Q9R1S7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Abcc6Q9R1S7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37,54■■■■□ 3,6
Abcc6Q9R1S7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Abcc6Q9R1S7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Abcc6Q9R1S7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
Abcc6Q9R1S7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Abcc6Q9R1S7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Abcc6Q9R1S7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Abcc6Q9R1S7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Abcc6Q9R1S7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Abcc6Q9R1S7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Abcc6Q9R1S7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37,35■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Abcc6Q9R1S7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Abcc6Q9R1S7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,22■■■■□ 3,55
Abcc6Q9R1S7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Abcc6Q9R1S7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Abcc6Q9R1S7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Abcc6Q9R1S7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Abcc6Q9R1S7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Abcc6Q9R1S7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Abcc6Q9R1S7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
Abcc6Q9R1S7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Abcc6Q9R1S7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Abcc6Q9R1S7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Abcc6Q9R1S7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37,07■■■■□ 3,53
Abcc6Q9R1S7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
Abcc6Q9R1S7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Abcc6Q9R1S7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Abcc6Q9R1S7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Abcc6Q9R1S7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Abcc6Q9R1S7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Abcc6Q9R1S7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Abcc6Q9R1S7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Abcc6Q9R1S7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Abcc6Q9R1S7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Abcc6Q9R1S7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,91■■■■□ 3,5
Abcc6Q9R1S7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Abcc6Q9R1S7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Abcc6Q9R1S7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Abcc6Q9R1S7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Abcc6Q9R1S7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Abcc6Q9R1S7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Abcc6Q9R1S7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36,81■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36,76■■■■□ 3,48
Abcc6Q9R1S7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36,7■■■■□ 3,47
Abcc6Q9R1S7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Abcc6Q9R1S7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Abcc6Q9R1S7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Abcc6Q9R1S7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Abcc6Q9R1S7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Abcc6Q9R1S7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,46
Abcc6Q9R1S7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Abcc6Q9R1S7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Abcc6Q9R1S7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Abcc6Q9R1S7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Abcc6Q9R1S7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Abcc6Q9R1S7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Abcc6Q9R1S7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,9 ms