Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CtsfQ9R013 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CtsfQ9R013 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CtsfQ9R013 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CtsfQ9R013 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CtsfQ9R013 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CtsfQ9R013 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CtsfQ9R013 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CtsfQ9R013 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CtsfQ9R013 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CtsfQ9R013 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CtsfQ9R013 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CtsfQ9R013 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CtsfQ9R013 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CtsfQ9R013 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtsfQ9R013 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtsfQ9R013 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms