Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr4a3Q9QZB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr4a3Q9QZB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr4a3Q9QZB6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr4a3Q9QZB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr4a3Q9QZB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr4a3Q9QZB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr4a3Q9QZB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr4a3Q9QZB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nr4a3Q9QZB6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr4a3Q9QZB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nr4a3Q9QZB6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nr4a3Q9QZB6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nr4a3Q9QZB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr4a3Q9QZB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr4a3Q9QZB6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr4a3Q9QZB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a3Q9QZB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a3Q9QZB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a3Q9QZB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr4a3Q9QZB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr4a3Q9QZB6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr4a3Q9QZB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms