Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn8Q9QZ49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn8Q9QZ49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn8Q9QZ49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn8Q9QZ49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn8Q9QZ49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubxn8Q9QZ49 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ubxn8Q9QZ49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn8Q9QZ49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn8Q9QZ49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms