Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snai3Q9QY31 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snai3Q9QY31 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai3Q9QY31 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai3Q9QY31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snai3Q9QY31 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms