Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN7

Klrc3, Killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrc3Q9QXN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klrc3Q9QXN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klrc3Q9QXN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klrc3Q9QXN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klrc3Q9QXN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klrc3Q9QXN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klrc3Q9QXN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klrc3Q9QXN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klrc3Q9QXN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klrc3Q9QXN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klrc3Q9QXN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klrc3Q9QXN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klrc3Q9QXN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrc3Q9QXN7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klrc3Q9QXN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klrc3Q9QXN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klrc3Q9QXN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms