Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms