Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msrb1Q9JLC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msrb1Q9JLC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msrb1Q9JLC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msrb1Q9JLC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msrb1Q9JLC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms