Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rcan3Q9JKK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rcan3Q9JKK0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rcan3Q9JKK0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rcan3Q9JKK0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rcan3Q9JKK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rcan3Q9JKK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rcan3Q9JKK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rcan3Q9JKK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rcan3Q9JKK0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rcan3Q9JKK0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rcan3Q9JKK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rcan3Q9JKK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rcan3Q9JKK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rcan3Q9JKK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rcan3Q9JKK0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rcan3Q9JKK0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rcan3Q9JKK0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rcan3Q9JKK0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms