Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pard6bQ9JK83 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pard6bQ9JK83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pard6bQ9JK83 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pard6bQ9JK83 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pard6bQ9JK83 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pard6bQ9JK83 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard6bQ9JK83 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard6bQ9JK83 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pard6bQ9JK83 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pard6bQ9JK83 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pard6bQ9JK83 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pard6bQ9JK83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms