Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Copz2Q9JHH9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Copz2Q9JHH9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Copz2Q9JHH9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Copz2Q9JHH9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Copz2Q9JHH9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Copz2Q9JHH9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Copz2Q9JHH9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Copz2Q9JHH9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Copz2Q9JHH9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Copz2Q9JHH9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Copz2Q9JHH9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms