Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tfcp2Q9ERA0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tfcp2Q9ERA0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tfcp2Q9ERA0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tfcp2Q9ERA0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tfcp2Q9ERA0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tfcp2Q9ERA0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tfcp2Q9ERA0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tfcp2Q9ERA0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tfcp2Q9ERA0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tfcp2Q9ERA0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tfcp2Q9ERA0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tfcp2Q9ERA0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tfcp2Q9ERA0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms