Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barx1Q9ER42 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barx1Q9ER42 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx1Q9ER42 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx1Q9ER42 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Barx1Q9ER42 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Barx1Q9ER42 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx1Q9ER42 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx1Q9ER42 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx1Q9ER42 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Barx1Q9ER42 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Barx1Q9ER42 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Barx1Q9ER42 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Barx1Q9ER42 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Barx1Q9ER42 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx1Q9ER42 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms