Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox9Q9EQM5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox9Q9EQM5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox9Q9EQM5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox9Q9EQM5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox9Q9EQM5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox9Q9EQM5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox9Q9EQM5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms