Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgn3Q9DCB1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgn3Q9DCB1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgn3Q9DCB1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgn3Q9DCB1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgn3Q9DCB1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn3Q9DCB1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn3Q9DCB1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn3Q9DCB1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms