Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkar1aQ9DBC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkar1aQ9DBC7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkar1aQ9DBC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkar1aQ9DBC7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkar1aQ9DBC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkar1aQ9DBC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkar1aQ9DBC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkar1aQ9DBC7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkar1aQ9DBC7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkar1aQ9DBC7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkar1aQ9DBC7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkar1aQ9DBC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkar1aQ9DBC7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms