Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q3

1700034I23Rik, RIKEN cDNA 1700034I23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034I23RikQ9D9Q3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700034I23RikQ9D9Q3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700034I23RikQ9D9Q3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700034I23RikQ9D9Q3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700034I23RikQ9D9Q3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700034I23RikQ9D9Q3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700034I23RikQ9D9Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700034I23RikQ9D9Q3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700034I23RikQ9D9Q3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700034I23RikQ9D9Q3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700034I23RikQ9D9Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700034I23RikQ9D9Q3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700034I23RikQ9D9Q3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700034I23RikQ9D9Q3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700034I23RikQ9D9Q3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700034I23RikQ9D9Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms