Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D8Q6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8Q6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D8Q6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D8Q6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D8Q6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D8Q6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms