Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ifi35Q9D8C4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ifi35Q9D8C4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ifi35Q9D8C4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ifi35Q9D8C4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ifi35Q9D8C4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ifi35Q9D8C4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ifi35Q9D8C4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ifi35Q9D8C4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ifi35Q9D8C4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ifi35Q9D8C4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ifi35Q9D8C4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ifi35Q9D8C4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ifi35Q9D8C4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifi35Q9D8C4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifi35Q9D8C4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ifi35Q9D8C4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ifi35Q9D8C4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ifi35Q9D8C4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ifi35Q9D8C4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ifi35Q9D8C4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifi35Q9D8C4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifi35Q9D8C4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifi35Q9D8C4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms