Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
2310002L09RikQ9D7L5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
2310002L09RikQ9D7L5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
2310002L09RikQ9D7L5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
2310002L09RikQ9D7L5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
2310002L09RikQ9D7L5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
2310002L09RikQ9D7L5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
2310002L09RikQ9D7L5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
2310002L09RikQ9D7L5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
2310002L09RikQ9D7L5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
2310002L09RikQ9D7L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
2310002L09RikQ9D7L5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
2310002L09RikQ9D7L5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
2310002L09RikQ9D7L5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
2310002L09RikQ9D7L5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
2310002L09RikQ9D7L5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
2310002L09RikQ9D7L5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.54■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
2310002L09RikQ9D7L5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms