Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbe1Q9D6Y9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gbe1Q9D6Y9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gbe1Q9D6Y9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gbe1Q9D6Y9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbe1Q9D6Y9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbe1Q9D6Y9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbe1Q9D6Y9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbe1Q9D6Y9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbe1Q9D6Y9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbe1Q9D6Y9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbe1Q9D6Y9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbe1Q9D6Y9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbe1Q9D6Y9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbe1Q9D6Y9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbe1Q9D6Y9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms