Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc83Q9D4V3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc83Q9D4V3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc83Q9D4V3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc83Q9D4V3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc83Q9D4V3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc83Q9D4V3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc83Q9D4V3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc83Q9D4V3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc83Q9D4V3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc83Q9D4V3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc83Q9D4V3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc83Q9D4V3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc83Q9D4V3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc83Q9D4V3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc83Q9D4V3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc83Q9D4V3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms