Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clvs1Q9D4C9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clvs1Q9D4C9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clvs1Q9D4C9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clvs1Q9D4C9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clvs1Q9D4C9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clvs1Q9D4C9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clvs1Q9D4C9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clvs1Q9D4C9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clvs1Q9D4C9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clvs1Q9D4C9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clvs1Q9D4C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clvs1Q9D4C9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clvs1Q9D4C9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clvs1Q9D4C9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms