Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
4933428G20RikQ9D3X4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
4933428G20RikQ9D3X4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
4933428G20RikQ9D3X4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
4933428G20RikQ9D3X4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms