Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph14Q9D3W1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph14Q9D3W1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rsph14Q9D3W1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph14Q9D3W1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph14Q9D3W1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph14Q9D3W1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rsph14Q9D3W1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph14Q9D3W1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph14Q9D3W1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms