Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Trim42Q9D2H5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Trim42Q9D2H5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Trim42Q9D2H5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trim42Q9D2H5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trim42Q9D2H5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Trim42Q9D2H5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Trim42Q9D2H5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Trim42Q9D2H5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim42Q9D2H5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim42Q9D2H5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim42Q9D2H5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim42Q9D2H5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Trim42Q9D2H5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Trim42Q9D2H5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Trim42Q9D2H5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Trim42Q9D2H5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Trim42Q9D2H5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Trim42Q9D2H5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms