Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ToporslQ9D2F8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ToporslQ9D2F8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ToporslQ9D2F8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ToporslQ9D2F8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ToporslQ9D2F8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ToporslQ9D2F8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ToporslQ9D2F8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ToporslQ9D2F8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ToporslQ9D2F8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ToporslQ9D2F8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ToporslQ9D2F8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ToporslQ9D2F8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ToporslQ9D2F8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ToporslQ9D2F8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ToporslQ9D2F8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms