Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Krtap5-3Q9D226 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Krtap5-3Q9D226 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Krtap5-3Q9D226 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Krtap5-3Q9D226 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krtap5-3Q9D226 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krtap5-3Q9D226 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Krtap5-3Q9D226 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krtap5-3Q9D226 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krtap5-3Q9D226 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Krtap5-3Q9D226 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krtap5-3Q9D226 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Krtap5-3Q9D226 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krtap5-3Q9D226 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms