Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Krtap5-3Q9D226 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Krtap5-3Q9D226 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Krtap5-3Q9D226 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Krtap5-3Q9D226 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Krtap5-3Q9D226 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Krtap5-3Q9D226 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Krtap5-3Q9D226 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Krtap5-3Q9D226 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Krtap5-3Q9D226 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Krtap5-3Q9D226 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Krtap5-3Q9D226 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Krtap5-3Q9D226 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Krtap5-3Q9D226 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Krtap5-3Q9D226 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms