Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D131 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D131 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D131 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D131 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D131 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D131 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D131 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D131 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D131 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D131 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D131 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D131 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D131 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D131 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D131 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D131 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D131 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D131 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D131 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D131 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D131 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D131 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D131 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D131 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D131 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D131 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D131 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D131 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D131 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D131 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D131 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D131 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D131 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D131 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D131 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D131 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D131 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D131 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D131 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D131 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D131 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D131 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D131 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D131 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D131 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D131 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D131 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D131 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D131 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D131 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D131 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D131 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D131 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D131 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D131 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D131 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D131 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D131 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D131 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D131 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D131 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D131 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D131 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D131 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D131 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D131 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D131 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D131 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D131 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D131 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D131 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D131 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D131 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D131 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D131 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D131 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D131 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D131 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D131 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D131 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D131 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D131 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D131 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D131 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D131 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms