Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0S4

Neurl2, Neuralized-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl2Q9D0S4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurl2Q9D0S4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurl2Q9D0S4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurl2Q9D0S4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl2Q9D0S4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl2Q9D0S4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurl2Q9D0S4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurl2Q9D0S4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurl2Q9D0S4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurl2Q9D0S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurl2Q9D0S4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurl2Q9D0S4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurl2Q9D0S4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurl2Q9D0S4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl2Q9D0S4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl2Q9D0S4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms