Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndc80Q9D0F1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ndc80Q9D0F1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndc80Q9D0F1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndc80Q9D0F1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndc80Q9D0F1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndc80Q9D0F1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndc80Q9D0F1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndc80Q9D0F1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndc80Q9D0F1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndc80Q9D0F1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndc80Q9D0F1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndc80Q9D0F1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndc80Q9D0F1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndc80Q9D0F1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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