Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ribc1Q9D0B8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ribc1Q9D0B8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ribc1Q9D0B8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ribc1Q9D0B8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ribc1Q9D0B8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ribc1Q9D0B8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ribc1Q9D0B8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ribc1Q9D0B8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,55■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ribc1Q9D0B8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ribc1Q9D0B8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ribc1Q9D0B8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ribc1Q9D0B8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ribc1Q9D0B8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ribc1Q9D0B8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ribc1Q9D0B8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms