Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmss1Q9CZT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmss1Q9CZT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmss1Q9CZT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmss1Q9CZT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmss1Q9CZT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmss1Q9CZT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmss1Q9CZT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmss1Q9CZT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms