Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FopnlQ9CZS3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FopnlQ9CZS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FopnlQ9CZS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FopnlQ9CZS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FopnlQ9CZS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FopnlQ9CZS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FopnlQ9CZS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FopnlQ9CZS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FopnlQ9CZS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms