Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mis18aQ9CZJ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mis18aQ9CZJ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mis18aQ9CZJ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mis18aQ9CZJ6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mis18aQ9CZJ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mis18aQ9CZJ6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mis18aQ9CZJ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mis18aQ9CZJ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms