Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx47Q9CWX9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx47Q9CWX9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx47Q9CWX9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx47Q9CWX9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx47Q9CWX9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddx47Q9CWX9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddx47Q9CWX9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ddx47Q9CWX9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms