Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx2Q9CWK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx2Q9CWK8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx2Q9CWK8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx2Q9CWK8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx2Q9CWK8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx2Q9CWK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx2Q9CWK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms