Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhfpl3Q9CTN8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lhfpl3Q9CTN8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lhfpl3Q9CTN8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhfpl3Q9CTN8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms