Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY9

Ndufc1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufc1Q9CQY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufc1Q9CQY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufc1Q9CQY9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufc1Q9CQY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufc1Q9CQY9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms