Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PclafQ9CQX4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PclafQ9CQX4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PclafQ9CQX4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PclafQ9CQX4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PclafQ9CQX4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PclafQ9CQX4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PclafQ9CQX4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PclafQ9CQX4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PclafQ9CQX4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PclafQ9CQX4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PclafQ9CQX4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PclafQ9CQX4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PclafQ9CQX4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PclafQ9CQX4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PclafQ9CQX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PclafQ9CQX4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms