Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed6Q9CQG0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed6Q9CQG0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmed6Q9CQG0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmed6Q9CQG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed6Q9CQG0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms