Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700029P11RikQ9CQ68 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700029P11RikQ9CQ68 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700029P11RikQ9CQ68 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700029P11RikQ9CQ68 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700029P11RikQ9CQ68 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700029P11RikQ9CQ68 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700029P11RikQ9CQ68 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms