Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc18Q9CQ07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc18Q9CQ07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc18Q9CQ07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc18Q9CQ07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc18Q9CQ07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc18Q9CQ07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc18Q9CQ07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc18Q9CQ07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc18Q9CQ07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc18Q9CQ07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms