Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW4

Arpc5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5Q9CPW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Arpc5Q9CPW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Arpc5Q9CPW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Arpc5Q9CPW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Arpc5Q9CPW4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Arpc5Q9CPW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Arpc5Q9CPW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Arpc5Q9CPW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20,45■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Arpc5Q9CPW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms